發酵工程中常用的培養基主要分為以下幾類：

1. 合成培養基：合成培養基的成分明確，化學成分穩定，適合實驗室研究微生物生理、遺傳育種及高產菌種性能的研究。例如高氏一號培養基和察氏培養基。

2. 天然培養基：利用植物和動物組織微生物的浸出物、水解液等物質制成的培養基，如牛肉膏、酵母膏、麥芽汁等。這類培養基配制方便、經濟、營養豐富，但化學成分不穩定。

3. 半合成培養基：以天然有機物作為碳源、氮源及生長因子的來源，并適當加入化學藥品以補充無機鹽成分。例如馬鈴薯蔗糖培養基。

4. 基礎培養基：也稱最x低限度培養基，能滿足某菌種野生型菌株最x低營養要求的合成培養基。

5. 增殖培養基：富集培養基的一種，用于培養對營養要求苛刻的異養型微生物或選擇性培養某中微生物。

6. 鑒別培養基：通過添加化學試劑，使微生物生長過程中產生的特殊代謝產物與試劑反應，從而鑒別不同種類的微生物。如伊紅-美藍乳糖培養基。

7. 選擇培養基：根據微生物的特殊營養要求或對某些物理、化學條件的抗性設計的培養基，用于從混雜的微生物群體中分離出特定微生物。

8. 固體培養基：在液態培養基中加入凝固劑（如瓊脂、明膠等）制備的固態培養基，常用于微生物分離、鑒定、計數和菌種保存。

9. 液體培養基：水溶液或液體狀態的培養基，工業上絕大多數發酵都采用液體培養基。

10. 繁殖和保藏培養基：主要用于微生物細胞生長、繁殖和保藏，如斜面培養基、麩曲培養基等。

11. 種子培養基：適合微生物菌體生長的培養基，為發酵提供數量較多、強壯而整齊的種子細胞。

這些培養基根據不同的微生物種類、發酵目的和工藝需求，可以單獨使用或組合使用，以達到最x佳的發酵效果。